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DB12T_504-2014水稻转基因成分筛查方法PDF

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ICS 65.020.01 B 04 DB12 天津市 地方标准 DB12/T 504—2014 水稻转基因成分筛查方法 Screening method for genetically modified rice 2014-04-22发布 2014-07-20实施 天津市质量技术监督局发布 DB12/T 504—2014 前 言 本标准按照 GB/T 1.1—2009给出的规则起草。 本标准由天津市质量技术监督局提出。 本标准起草单位:天津市东丽区产品质量监督检验所、天津市农业质量标准与检测技术研究所。 本标准主要起草人:黄凤军、朱珠、易萌、杨炳存、刘文、赵新、李阳、闫荣卿。 本标准 2014年04月首次发布。 1 DB12/T 504—2014 水稻转基因成分筛查方法 1范围 本标准规定了水稻中转基因成分定性 PCR筛查的术语和定义、检测方法、结果分析与表述。 本标准适用于水稻及其制品中 SPS基因、CaMV35S启动子、NOS终止子、Bt基因、NPTII基因和 HPT基因的定性PCR筛查检测。 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。 凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T 6682分析实验室用水规格和试验方法 NY/T 672转基因植物及其产品检测通用要求 农业部 1485号公告—4—2010转基因植物及其产品成分检测 DNA提取和纯化 农业部 2031号公告—19—2013转基因植物及其产品检测抽样 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 3.1 SPS基因 SPS gene 编码蔗糖磷酸合酶(sucrose phosphate synthase)的基因。 3.2 CaMV 35S启动子 35S promoter from cauliflower mosaic virus(CaMV) 来自花椰菜花叶病毒的 35S启动子。 3.3 NOS终止子 terminator of nopaline synthase(NOS)gene 来自胭脂碱合成酶基因 NOS的终止子。 3.4 Bt基因 Bt(Bacillus thuringiensis)gene 来源与苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,简称Bt),可表达一种杀虫晶体蛋白的基因,常见 的Bt基因有cry1Ac基因、cry1Ab基因、cry1Ab/cry1Ac融合基因。 3.5 NPTII基因 NPTIIgene 来源于大肠杆菌(Escherichia coli),编码新霉素磷酸转移酶(neomycin phosphotransferase)的基 因。。 3.6 HPT基因 HPTgene 来自大肠杆菌或链球菌(Streptomyceshygroscopicus),编码潮霉素磷酸转移酶(hygromycin phosphotransferase)的基因。 1 DB12/T 504—2014 4检测方法 4.1试剂和材料 4.1.1实验用水为重蒸馏水或符合 GB/T 6682规定的一级水。 4.1.2琼脂糖。 4.1.310g/L溴化乙锭溶液:称取1.0 g溴化乙锭(EB),溶于100 mL水中,避光保存。 注:溴化乙锭有致癌作用,配制和使用时应戴一次性手套操作并妥善处理废液。 4.1.410mol/L氢氧化钠溶液:在160 mL水中加入80.0 g氢氧化钠(NaOH),溶解后再加水定容 到 200 mL。 4.1.5500 mmol/L乙二铵四乙酸二钠溶液(pH8.0):称取 18.6 g乙二铵四乙酸二钠(EDTA-Na2), 加入 70 mL水中,再加入适量氢氧化钠溶液(4.1.4),加热至完全溶解后,冷却至室温,用氢氧化钠 溶液(4.1.4)调 pH至8.0,加水定容至 100 mL。在 103.4 kPa(121 ℃)条件下灭菌 20 min。 4.1.61mol/L三羟甲基氨基甲烷-盐酸溶液(pH 8.0):称取121.1 g三羟甲基氨基甲烷(Tris)溶 解于 800 mL水中,用盐酸调pH至8.0,加水定容至 1 000 mL。在 103.4 kPa(121 ℃)条件下灭菌 20 min。 4.1.7 TE缓冲液(pH 8.0):分别量取10 mL三羟甲基氨基甲烷-盐酸溶液(4.1.6)和2 mL乙二铵 四乙酸二钠溶液(4.1.5),加水定容至 1 000 mL。在 103.4 kPa(121 ℃)条件下灭菌 20 min。 4.1.850×TAE缓冲液:称取242.2 g三羟甲基氨基甲烷(Tris),先用300 mL水加热搅拌溶解后, 加 100 mL乙二铵四乙酸二钠溶液(4.1.5),用冰乙酸调pH至8.0,然后加水定容到 1 000 mL。使用时 用水稀释成 1×TAE。 4.1.9加样缓冲液:称取 250.0 mg溴酚蓝,加10 mL水,在室温下溶解12 h;称取 250.0 mg二甲基 苯腈蓝,用 10 mL水溶解;称取50.0 g蔗糖,用30 mL水溶解。混合以上三种溶液,加水定容至100 mL, 在 4℃下保存。 4.1.10 4.1.11 DNA分子量标准:可以清楚的区分50 bp~1 000 bp的DNA片段。 dNTPs混合溶液:将浓度为10 mmol/L的dATP、dTTP、dGTP、dCTP四种脱氧核糖核苷酸 溶液等体积混合。 4.1.12 4.1.13 Taq DNA聚合酶、PCR反应缓冲液及25mmol/L氯化镁溶液。 引物:水稻内标准基因和转基因水稻外源基因检测时所用的引物序列见表 1。 表1水稻内标准基因和转基因水稻外源基因引物序列 检测基因 引物序列 扩增片段长度 基因性质 SPS -F:5′-ATCTGTTTACTCGTCAAGTGTCATCTC-3′ SPS -R:5′-GCCATGGATTACATATGGCAAGA-3′ 35S -F:5′-GCTCCTACAAATGCCATCATTGC-3′ 35S -R:5′-GATAGTGGGATTGTGCGTCATCCC-3′ NOS -F:5′-GAATCCTGTTGCCGGTCTTG-3′ NOS -R:5′-TTATCCTA